这一边，何进的士兵很轻松地就攻破了苍龙门，大举涌入南宫之中。进了宫后，何进沉着地分兵派去攻下何控制住每一座宫殿，凡是胆敢反抗的，亦或是身披铠甲、手持兵器的，一律就地诛杀。当然何进也没有忘了何皇后和刘辩，他派何苗前去保护长秋宫。
何皇后一觉醒来，仍旧挣扎在对刘范的厌弃怨恨之中的她，突然听见一阵巨响，然后紧接着便听着南宫南边传来了声势浩大的喊杀声。何皇后第一反应是慌乱，但也很快冷静下来。她不能肯定外面的动乱是谁发起，更不能确定是谁取胜，所以再三思考后她决定不舍身犯险，尽量保护好自己。于是她命令宫中的宦官宫女把长秋宫的大小门户全都封闭。
听着外面越来越大、越来越近的喊杀声，何皇后惊恐万分，把儿子刘辩紧紧地抱在怀里。但很快，一名宫女从外跑进来，告诉她，门外传来了车骑将军何苗的声音。何皇后喜出望外，赶紧跑到了宫门那，命令宦官们打开宫门，她一看果然是她的二兄赶到了。何苗将一切的事简短地告诉了何皇后，她才知道刘宏居然已经死了，蹇硕居然意图作乱。
但她很快想到，现在刘宏已死、蹇硕已败，正是她的儿子刘辩继位的最佳时机。于是她命令何苗派人去控制住尚书台，并派人去叫尚书令曹操回来，命他在尚书台下令百官入朝。而她，则带着刘辩跟着何苗走出长秋宫，一同赶去与何进汇合。很快他们便同何进汇合一处，这时，何进也已经完全控制住了整个南宫，配合着控制复道的袁术，一同把蹇硕和毕岚的残兵败将包围起来。
蹇硕和毕岚此时围在正中，残兵败将还剩三百余，他们瑟瑟发抖地面对着数十倍的何进的军队。
何进从人群中走出，高喊道：“蹇硕、毕岚，事已至此，何不投降？！”
蹇硕早已狼狈得是衣冠不整、披头散发，他知道到了这般地步，西园军大概早已让何进给控制住了，他再也无法为刘宏完成遗愿了。绝望之下，蹇硕仰天长叹，双目泪下，哭声苍凉。他面朝着北方颓然跪下，大哭道：“陛下，老奴有负陛下厚恩，这便来九泉之下陪伴陛下！”
说着，他愤然扬起佩刀来，在脖子上一拉，立即鲜血泵溅。而后蹇硕向着北方，无力地倒下了。眼睁睁地看着蹇硕自尽，毕岚悲痛欲绝。他又顾念到追随他们二人的众多的士兵，对何进指着他的士兵，慨然说：“此事发起，皆由我二人所为，与他们无干。我事已败，尔既然已胜，愿存怜悯之心，勿复迁怒无辜之人。”
还没等何进回答，毕岚也面朝嘉德殿的方向跪下，哭喊道：“陛下、蹇兄，毕岚亦来矣！”说着，他双手反握弯刀，奋力刺入腹中。刀尖从他的后背露出，毕岚随即口喷鲜血，无力倒下。
何进、何苗、何皇后本以为可以生擒二人，却没想到二人求死之欲有如此强烈，竟然当场自尽，无不震惊万分。但袁术还是劝动了何进，将蹇硕和毕岚最后的士兵也尽数诛杀。
除掉了二人后，何进从毕岚怀里得到了遗诏。打开遗诏后见了里面的内容，看得他一阵恶寒。他才知道，原来这一切其实都是刘宏指使的，心中对已死的刘宏十分怨恨。
何进又命士兵在宫中大肆搜捕蹇硕与毕岚的心腹，趁乱一同杀掉。此时袁绍劝谏何进，应当趁此机会，把宫中宦官全都集中抓捕起来，再集中诛杀掉，永绝后患。正踌躇满志的何进很快便接受了袁绍的建议，派何苗去把所有宦官全都抓捕起来，押送到这里来。
很快，何苗的兵士便把一群群宦官，用长绳给一同捆住，押送到了复道之前。何皇后本来并不阻拦，但却看见宋典、孙璋、高望等人也在其中。而且她也知道，基本上所有幸存下来的宦官，其实都是他们的心腹部下。
在这场宫变中，她清楚地看到掌握着庞大军队的何进的强大。她更清楚的是，将来他会成为下一个梁冀，执掌朝政。何忆开始担忧，何进在此时就已经如此强大和跋扈，在执掌大权之后，还会不会如往常一样遵从她这个将来的太后的命令？会不会如同梁冀一样，如果即将成为皇帝的刘辩不听他的话，他会不会也毒杀他的亲外甥？
况且在前不久，宋典、孙璋、高望、段硅、韩悝等人曾经为她求情，这说明他们有极大的可能会投靠于她。留下他们，或许对于她将来会有不小的帮助。
有了这些担忧，何忆明白她该怎么做了。何忆便冷冷地道：“重用宦官，本是汉朝制度。如若杀尽，宫中谁来值守从事？蹇硕与毕岚已死，我等已再无威胁。若再行无名杀戮，岂不是叫百官恐惧，动摇其心邪？”
“这……”听了何皇后的话，何进开始犹豫了。
一旁的车骑将军何苗是一向最听何忆的话，他迅速附和道：“娘娘说的极是，我等现在当务之急，是必须尽快召集群臣到嘉德殿，在大行皇帝面前，宣读遗诏，让辩儿顺利继位。此时若再杀尽宦官，只恐三公九卿等便要怀疑我等乃篡位了。”
袁绍却坚持说：“娘娘，宦官为祸已久，流毒久远。自光武帝以来，败在宦官手下而被诛灭的汉家外戚，难道还少吗？此时正是一举铲除宦官的最佳时机，只要杀尽宦官，汉家幸甚，天下幸甚！愿娘娘思之！”
何忆不满地冷哼一声，说：“袁本初，当初你们袁氏不也是攀上了宦官，甚至有人认宦官为叔父，才能保存至今吗？若没有宦官，你们袁氏做得到四世三公吗？怎么？昨日才承了宦官的恩惠，今日便出尔反尔了？”
袁绍惭愧得涨红了脸，说不出话来。
何皇后又对何进道：“兄长，别忘了当初你也是得宦官看重，他们才肯把本宫送进宫里。否则我们何氏能有今日吗？今日我等已经血洗宫廷，没有了蹇硕与毕岚，谁还能威胁到我等？”